Родился 16 апреля 1923 года в высокогорном ауле Усур Ахтынского района (Дагестан).

В 1941 году окончил 9 классов Ахтынской средней школы. С началом войны прибыл в райвоенкомат с просьбой направить его добровольцем на фронт, но получил отказ и продолжил учебу в школе.

Закончить 10й класс не удалось: был призван в Красную Армию и направлен курсантом во 2-е пехотное училище в городе Орджоникидзе.

9 марта 1942 года в самый разгар учебы курсанты училища были направлены в Минеральные Воды для формирования ударной бригады, которой предстояло освобождать Ростов-на-Дону. Однако в конце марта Ростов удалось взять силами действующей армии и будущих офицеров вернули для продолжения учебы.

15 июня курсантов подняли по тревоге и, погрузив в эшелоны, отправили на станцию Ремонтную Дубовского района Ростовской области. В тамошних степях возникла угроза высадки немецкого десанта, поэтому 3й курсантский батальон направили для оказания отпора вероятному противнику.

Через месяц, 14 июля, курсантов снова погрузили в эшелон и отправили под Сталинград. Батальон, в котором находился Михаил Вагабов, высадился на станции Суровикино и на следующий день выдвинулся к линии фронта.

17 июля - день боевого крещения курсантов 3го батальона 2го пехотного училища. Молодые бойцы вступили в бой с пехотой противника. Свои позиции будущие офицеры удерживали до 6 августа, но затем пришлось отступать по всей линии фронта - перевес был на стороне немцев.

В ходе ночного отступления батальон вместе с основными силами 3 дивизий 62й армии оказался в окружении между двумя дорогами, ведущими из Нижне-Чирской и Верхне-Чирской на Калач. По этим дорогам двигались мощные колонны 6й немецкой армии. При попытке выйти из окружения батальон понес тяжелые потери: в суматохе под непрерывным артиллерийским огнем многие курсанты сгорели заживо на подожженном немцами пшеничном поле. Немецкие мотоциклисты догоняли убегавших и забирали в плен. Так 8 августа 1942 года перестал существовать 3й батальон 2го военно-пехотного Орджоникидзевского училища. Командир батальона В. И. Ткаченко был убит, Михаил Вагабов в числе других курсантов оказался в немецком плену.

Через месяц удалось сбежать и перейти линию фронта. Продолжал сражаться на различных фронтах до окончания войны: сначала в штурмовой, а затем в дальней бомбардировочной авиации.

25 декабря 1945 года демобилизовался и вернулся на родину. Окончив в 1952 году юридический факультет Азербайджанского государственного университета, посвятил себя науке: в 1963 году стал кандидатом философских наук, а в 1968-м - доктором. Был профессором, заведующим кафедрой Дагестанского государственного университета. Заслуженный деятель науки Российской Федерации и Республики Дагестан.

В настоящее время продолжает работать на кафедре основ религиоведения Дагестанского государственного университета. Автор книги "Великая Отечественная война глазами участника". Член Совета старейшин Госсовета Республики Дагестан.

Награжден орденами Отечественной войны I степени, Дружбы, медалью "За отвагу" и другими.

Живет в Махачкале.